Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms