Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC7Q5VTL7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC7Q5VTL7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC7Q5VTL7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC7Q5VTL7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC7Q5VTL7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC7Q5VTL7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNDC7Q5VTL7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNDC7Q5VTL7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms