Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim9Q3V0X1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim9Q3V0X1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim9Q3V0X1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim9Q3V0X1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim9Q3V0X1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim9Q3V0X1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim9Q3V0X1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim9Q3V0X1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim9Q3V0X1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim9Q3V0X1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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