Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TchpQ3TVW5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TchpQ3TVW5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms