Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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GBX1Q14549 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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GBX1Q14549 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GBX1Q14549 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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