Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
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SPIDRQ14159 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIDRQ14159 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIDRQ14159 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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