Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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