Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNH2Q12809 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNH2Q12809 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNH2Q12809 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNH2Q12809 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNH2Q12809 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNH2Q12809 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNH2Q12809 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNH2Q12809 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNH2Q12809 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNH2Q12809 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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