Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.96□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 STB6YKL072W 2301 nt0.96□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.96□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 CSN9YDR179C 489 nt0.95□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.95□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.95□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.94□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 IFH1YLR223C 3258 nt0.94□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 SLD3YGL113W 2007 nt0.94□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 YDR157WYDR157W 402 nt0.93□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.93□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 YOR121CYOR121C 306 nt0.93□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 YPL229WYPL229W 621 nt0.93□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 snR51snR51 107 nt0.93□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 NUP157YER105C 4176 nt0.93□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 RIM20YOR275C 1986 nt0.92□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 SAS3YBL052C 2496 nt0.92□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 RPS20YHL015W 366 nt0.92□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 YOR199WYOR199W 330 nt0.92□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 EFR3YMR212C 2349 nt0.91□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 RPS27AYKL156W 249 nt0.91□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.91□□□□□ -2.26
TY3A-GQ12173 IRC23YOR044W 474 nt0.9□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 SWI6YLR182W 2412 nt0.9□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 SMC1YFL008W 3678 nt0.88□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 SCW11YGL028C 1629 nt0.88□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 NIP100YPL174C 2607 nt0.87□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.87□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 RPB10YOR210W 213 nt0.87□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 ALY2YJL084C 3141 nt0.86□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 YDR426CYDR426C 378 nt0.86□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 YJR011CYJR011C 786 nt0.86□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 YOL160WYOL160W 342 nt0.86□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 SET3YKR029C 2256 nt0.86□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 ZIP2YGL249W 2115 nt0.85□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 NPC2YDL046W 522 nt0.85□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 YAR053WYAR053W 297 nt0.85□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 YLR334CYLR334C 381 nt0.85□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 CMC4YMR194C-B 222 nt0.85□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.85□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.85□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 INP2YMR163C 2118 nt0.85□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 RAD34YDR314C 2079 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 MMS4YBR098W 2076 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 YDL206WYDL206W 2289 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 RPL35AYDL191W 363 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 YPR012WYPR012W 255 nt0.84□□□□□ -2.27
TY3A-GQ12173 PDE2YOR360C 1581 nt0.83□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 ULP2YIL031W 3105 nt0.83□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 SLY1YDR189W 2001 nt0.83□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 LCD1YDR499W 2244 nt0.83□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 YDR521WYDR521W 336 nt0.83□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 YGR035CYGR035C 351 nt0.83□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 RPL38YLR325C 237 nt0.83□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 TRS65YGR166W 1683 nt0.82□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 MAM33YIL070C 801 nt0.82□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.82□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 YNL058CYNL058C 951 nt0.82□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 YPL261CYPL261C 309 nt0.82□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 STO1YMR125W 2586 nt0.82□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 NHP2YDL208W 471 nt0.81□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 YAF9YNL107W 681 nt0.81□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 YBR206WYBR206W 324 nt0.81□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.8□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 AI1Q0050 2505 nt0.8□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 SLI15YBR156C 2097 nt0.79□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 UTP8YGR128C 2142 nt0.79□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 HMRA1YCR097W 381 nt0.79□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.79□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 YPL225WYPL225W 441 nt0.79□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 YBR064WYBR064W 429 nt0.79□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 RKR1YMR247C 4689 nt0.79□□□□□ -2.28
TY3A-GQ12173 GIM4YEL003W 336 nt0.77□□□□□ -2.29
TY3A-GQ12173 SSS1YDR086C 243 nt0.76□□□□□ -2.29
TY3A-GQ12173 YAR029WYAR029W 225 nt0.76□□□□□ -2.29
TY3A-GQ12173 GEA2YEL022W 4380 nt0.76□□□□□ -2.29
TY3A-GQ12173 THO2YNL139C 4794 nt0.76□□□□□ -2.29
TY3A-GQ12173 YDR102CYDR102C 333 nt0.75□□□□□ -2.29
TY3A-GQ12173 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.75□□□□□ -2.29
TY3A-GQ12173 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.75□□□□□ -2.29
TY3A-GQ12173 FMP27YLR454W 7887 nt0.75□□□□□ -2.29
TY3A-GQ12173 PKH2YOL100W 3246 nt0.74□□□□□ -2.29
TY3A-GQ12173 snR56snR56 88 nt0.74□□□□□ -2.29
TY3A-GQ12173 YDR048CYDR048C 315 nt0.74□□□□□ -2.29
TY3A-GQ12173 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.74□□□□□ -2.29
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