Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPAL4Q0D2K0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms