Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms