Protein–RNA interactions for Protein: Q04749

AVO2, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO2, yeastyeast

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO2Q04749 UBX4YMR067C 1251 nt0.15□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 INP2YMR163C 2118 nt0.15□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 RPS30BYOR182C 192 nt0.15□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 PAU12YGR294W 363 nt0.14□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 VIK1YPL253C 1944 nt0.14□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 snR72snR72 98 nt0.13□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 PAA1YDR071C 576 nt0.13□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 OLI1Q0130 231 nt0.13□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 YGR290WYGR290W 444 nt0.13□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 snR51snR51 107 nt0.13□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 FYV10YIL097W 1551 nt0.13□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 PTP2YOR208W 2253 nt0.13□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 YCR001WYCR001W 315 nt0.12□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 YAP6YDR259C 1152 nt0.12□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.12□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 TRS65YGR166W 1683 nt0.11□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 ESP1YGR098C 4893 nt0.11□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 SPO21YOL091W 1830 nt0.11□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 STF2YGR008C 255 nt0.11□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 YBR064WYBR064W 429 nt0.11□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 EMC4YGL231C 573 nt0.1□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 MCM10YIL150C 1716 nt0.1□□□□□ -2.39
AVO2Q04749 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.09□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.09□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.09□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.09□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.09□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.09□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.09□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.09□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.09□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YNL058CYNL058C 951 nt0.09□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YDL011CYDL011C 324 nt0.08□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 WIP1YDR374W-A 270 nt0.08□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 SDH7YDR511W 402 nt0.08□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.08□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 NFU1YKL040C 771 nt0.08□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 HUG1YML058W-A 207 nt0.08□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 GPI15YNL038W 690 nt0.08□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 SEC8YPR055W 3198 nt0.08□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 RPS20YHL015W 366 nt0.07□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YLR269CYLR269C 351 nt0.07□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YPL229WYPL229W 621 nt0.07□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 MAM33YIL070C 801 nt0.06□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 COX5BYIL111W 456 nt0.06□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YBL071CYBL071C 309 nt0.06□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.06□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YLR287CYLR287C 1068 nt0.05□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.05□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YML108WYML108W 318 nt0.05□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.05□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YFL012WYFL012W 447 nt0.04□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 COX12YLR038C 252 nt0.04□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YBR206WYBR206W 324 nt0.04□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 HAL9YOL089C 3093 nt0.03□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 OST4YDL232W 111 nt0.03□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 RPF1YHR088W 888 nt0.03□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YJR011CYJR011C 786 nt0.03□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 EAF6YJR082C 342 nt0.03□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 YOL014WYOL014W 375 nt0.03□□□□□ -2.4
AVO2Q04749 PRP42YDR235W 1635 nt0.02□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 ATG31YDR022C 591 nt0.02□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 YHR125WYHR125W 306 nt0.02□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 YKL123WYKL123W 381 nt0.02□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.02□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 MYO1YHR023W 5787 nt0.02□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 PRP5YBR237W 2550 nt0.01□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 YNL319WYNL319W 441 nt0.01□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 ZEO1YOL109W 342 nt0.01□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 THO2YNL139C 4794 nt0.01□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 NIP100YPL174C 2607 nt0□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 ASE1YOR058C 2658 nt0□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 YHL041WYHL041W 450 nt0□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 DIE2YGR227W 1578 nt-0.01□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.01□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.01□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 YKL083WYKL083W 615 nt-0.01□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.01□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 YMR321CYMR321C 318 nt-0.02□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 YOR053WYOR053W 342 nt-0.02□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 YNL211CYNL211C 261 nt-0.03□□□□□ -2.41
AVO2Q04749 COG8YML071C 1824 nt-0.03□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.04□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-0.04□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 YHR130CYHR130C 336 nt-0.04□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 YLR171WYLR171W 390 nt-0.04□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 HMRA2YCR096C 360 nt-0.05□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 QCR9YGR183C 201 nt-0.05□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 YML007C-AYML007C-A 111 nt-0.05□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-0.05□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 snR190snR190 190 nt-0.05□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.06□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 YER084W-AYER084W-A 513 nt-0.06□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 YAR047CYAR047C 321 nt-0.06□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.06□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt-0.06□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 ORC3YLL004W 1851 nt-0.06□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 RCO1YMR075W 2055 nt-0.06□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 NNF2YGR089W 2811 nt-0.07□□□□□ -2.42
AVO2Q04749 RPS26AYGL189C 360 nt-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 100.9 ms