Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabra1P62812 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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