Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF1P30408 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms