Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSFA2P28290 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSFA2P28290 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms