Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRDP23468 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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