Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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