Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX7O95931 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX7O95931 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX7O95931 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX7O95931 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX7O95931 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX7O95931 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX7O95931 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX7O95931 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX7O95931 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX7O95931 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX7O95931 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX7O95931 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX7O95931 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX7O95931 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX7O95931 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX7O95931 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX7O95931 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms