Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F3O00716 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F3O00716 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F3O00716 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F3O00716 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F3O00716 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F3O00716 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F3O00716 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F3O00716 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F3O00716 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F3O00716 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F3O00716 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F3O00716 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms