Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRPRBQ9Y5M8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms