Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG6Q9Y2V7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG6Q9Y2V7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms