Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms