Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms