Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CWC25Q9NXE8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CWC25Q9NXE8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms