Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AL162385.1-201ENST00000451595 1202 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC097487.1-201ENST00000514134 934 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC018362.1-201ENST00000564805 846 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
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