Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx5Q9D8U8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx5Q9D8U8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms