Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rab5aQ9CQD1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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