Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms