Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRERF1Q96PN7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms