Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20AQ96MK3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms