Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PHF3Q92576 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms