Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOPBP1Q92547 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms