Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG8Q8ND04 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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