Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q595

SCS22, Vesicle-associated membrane protein-associated protein SCS22, yeastyeast

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SCS22Q6Q595 YGL230CYGL230C 444 nt0.13□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 YLR252WYLR252W 306 nt0.13□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 YPT6YLR262C 648 nt0.13□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 CDC33YOL139C 642 nt0.13□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 LOA1YPR139C 903 nt0.13□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 AI1Q0050 2505 nt0.13□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 ZIP2YGL249W 2115 nt0.12□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 UBX4YMR067C 1251 nt0.12□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 YMR254CYMR254C 309 nt0.12□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 YCK3YER123W 1575 nt0.11□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 snR9snR9 187 nt0.11□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 YHL042WYHL042W 453 nt0.11□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 YOR248WYOR248W 303 nt0.11□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 TRS65YGR166W 1683 nt0.11□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.1□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 YCL002CYCL002C 792 nt0.1□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 PET111YMR257C 2403 nt0.1□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 PKH2YOL100W 3246 nt0.09□□□□□ -2.39
SCS22Q6Q595 YDR269CYDR269C 324 nt0.09□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 SPO13YHR014W 876 nt0.09□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 ILM1YJR118C 612 nt0.09□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 RPL26AYLR344W 384 nt0.09□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 BSC3YLR465C 309 nt0.09□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 UBC7YMR022W 498 nt0.09□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 IQG1YPL242C 4488 nt0.09□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.08□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.08□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 MRPL32YCR003W 552 nt0.07□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 RPS30BYOR182C 192 nt0.07□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 THO2YNL139C 4794 nt0.06□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 MND1YGL183C 660 nt0.06□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 SLX9YGR081C 633 nt0.06□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 SCEIQ0160 708 nt0.06□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 RCN2YOR220W 798 nt0.06□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 STF2YGR008C 255 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 YGR290WYGR290W 444 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 BIG1YHR101C 1008 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 YJL135WYJL135W 318 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 YBR063CYBR063C 1215 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 IRC16YPR038W 360 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 YPR039WYPR039W 336 nt0.05□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 AFR1YDR085C 1863 nt0.04□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 FYV10YIL097W 1551 nt0.04□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 YPL044CYPL044C 549 nt0.04□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.04□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 VIK1YPL253C 1944 nt0.03□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 PHS1YJL097W 654 nt0.03□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 MRPS8YMR158W 468 nt0.03□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.03□□□□□ -2.4
SCS22Q6Q595 EFR3YMR212C 2349 nt0.02□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.02□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 WIP1YDR374W-A 270 nt0.02□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 VMA21YGR105W 234 nt0.02□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 AFB1YLR040C 675 nt0.02□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 ESP1YGR098C 4893 nt0.02□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 INP2YMR163C 2118 nt0.01□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 YDL187CYDL187C 330 nt0.01□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 COX12YLR038C 252 nt0.01□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 YGL239CYGL239C 315 nt0□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 ECM9YKR004C 1134 nt0□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 YNL050CYNL050C 813 nt0□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 RPB10YOR210W 213 nt0□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 CUL3YGR003W 2235 nt-0.01□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.01□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 YBR064WYBR064W 429 nt-0.01□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 MCM10YIL150C 1716 nt-0.01□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 MLP1YKR095W 5628 nt-0.02□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 YCR100CYCR100C 951 nt-0.02□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 HUG1YML058W-A 207 nt-0.02□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 YER135CYER135C 393 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 OLI1Q0130 231 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 YJR087WYJR087W 351 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 PRP5YBR237W 2550 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCS22Q6Q595 MYO1YHR023W 5787 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCS22Q6Q595 APQ13YJL075C 417 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCS22Q6Q595 YOL160WYOL160W 342 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCS22Q6Q595 snR13snR13 124 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCS22Q6Q595 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCS22Q6Q595 YLR198CYLR198C 360 nt-0.05□□□□□ -2.42
SCS22Q6Q595 YOR053WYOR053W 342 nt-0.05□□□□□ -2.42
SCS22Q6Q595 PRP42YDR235W 1635 nt-0.05□□□□□ -2.42
SCS22Q6Q595 snR72snR72 98 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCS22Q6Q595 YDR029WYDR029W 315 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCS22Q6Q595 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCS22Q6Q595 YER175W-AYER175W-A 165 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCS22Q6Q595 HUR1YGL168W 333 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCS22Q6Q595 RPS27AYKL156W 249 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCS22Q6Q595 YOL014WYOL014W 375 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCS22Q6Q595 RAD34YDR314C 2079 nt-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 93.6 ms