Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms