Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms