Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB3GAP1Q15042 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3GAP1Q15042 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms