Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PMS2P3Q13401 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms