Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 INP52YNL106C 3552 nt3.7□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 YPL150WYPL150W 2706 nt3.7□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt3.7□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 ACB1YGR037C 264 nt3.7□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt3.7□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 CRM1YGR218W 3255 nt3.7□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 SMC2YFR031C 3513 nt3.7□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 RGA2YDR379W 3030 nt3.7□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 VBA4YDR119W 2307 nt3.7□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 MLH3YPL164C 2148 nt3.7□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 SIZ1YDR409W 2715 nt3.69□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 RRP12YPL012W 3687 nt3.69□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 RGM1YMR182C 636 nt3.68□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 CIN8YEL061C 3003 nt3.68□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.67□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.67□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.67□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.67□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.67□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 YCL019WYCL019W 5313 nt3.67□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt3.67□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 POM152YMR129W 4014 nt3.67□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 MDM1YML104C 3384 nt3.66□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 ATG11YPR049C 3537 nt3.66□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 YDR210WYDR210W 228 nt3.66□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.66□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 IRR1YIL026C 3453 nt3.65□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 PAU8YAL068C 363 nt3.65□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 PAU18YLL064C 363 nt3.65□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 PAU6YNR076W 363 nt3.65□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 PAU20YOL161C 363 nt3.65□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 SRO77YBL106C 3033 nt3.65□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 PTP2YOR208W 2253 nt3.64□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 RIC1YLR039C 3171 nt3.64□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 STU1YBL034C 4542 nt3.63□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 SNC1YAL030W 354 nt3.63□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 DUG2YBR281C 2637 nt3.63□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 NEW1YPL226W 3591 nt3.63□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 MYO5YMR109W 3660 nt3.63□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 SGM1YJR134C 2124 nt3.62□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 STB4YMR019W 2850 nt3.62□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt3.62□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 YLR232WYLR232W 348 nt3.62□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 GCN1YGL195W 8019 nt3.61□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 TAH1YCR060W 336 nt3.61□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 CRS5YOR031W 210 nt3.61□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 DGR2YKL121W 2559 nt3.61□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 APL2YKL135C 2181 nt3.61□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 DNL4YOR005C 2835 nt3.6□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 CSR2YPR030W 3366 nt3.6□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 MNL2YLR057W 2550 nt3.6□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 KSP1YHR082C 3090 nt3.59□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 SUL1YBR294W 2580 nt3.59□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 CHS2YBR038W 2892 nt3.59□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 MMS4YBR098W 2076 nt3.59□□□□□ -1.83
MSB4Q12317 VPS3YDR495C 3036 nt3.59□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 HRD3YLR207W 2502 nt3.59□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 TAF2YCR042C 4224 nt3.58□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 RTT10YPL183C 3042 nt3.57□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 YPL216WYPL216W 3309 nt3.57□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 KTI11YBL071W-A 249 nt3.57□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 FLO9YAL063C 3969 nt3.57□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 EAF1YDR359C 2949 nt3.56□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 YBT1YLL048C 4986 nt3.56□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 SAP190YKR028W 3102 nt3.55□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 MAK10YEL053C 2202 nt3.55□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 YKL225WYKL225W 348 nt3.55□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 STT4YLR305C 5703 nt3.55□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt3.54□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 snR76snR76 109 nt3.54□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.54□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.54□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.54□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.54□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.54□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.54□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 YIL169CYIL169C 2988 nt3.54□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 RPS28BYLR264W 204 nt3.54□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt3.54□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 SPO22YIL073C 2928 nt3.54□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 ENA5YDR038C 3276 nt3.54□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 SAS3YBL052C 2496 nt3.53□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 TCB2YNL087W 3537 nt3.53□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 PHO91YNR013C 2685 nt3.53□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 RIF1YBR275C 5751 nt3.53□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt3.53□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 RPN1YHR027C 2982 nt3.53□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 ILS1YBL076C 3219 nt3.53□□□□□ -1.84
MSB4Q12317 ALK1YGL021W 2283 nt3.53□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 MSB2YGR014W 3921 nt3.52□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 TAE2YPL009C 3117 nt3.52□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 NMD2YHR077C 3270 nt3.52□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 VMR1YHL035C 4779 nt3.52□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 POL2YNL262W 6669 nt3.52□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 UBP15YMR304W 3693 nt3.52□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 ENV11YGR071C 2583 nt3.52□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 SPO14YKR031C 5052 nt3.51□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 RPL37BYDR500C 267 nt3.51□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt3.51□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 FLO1YAR050W 4614 nt3.51□□□□□ -1.85
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