Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms