Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps28P62858 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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