Protein–RNA interactions for Protein: P53551

HHO1, Histone H1, yeastyeast

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HHO1P53551 RFX1YLR176C 2436 nt0□□□□□ -2.41
HHO1P53551 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0□□□□□ -2.41
HHO1P53551 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt-0□□□□□ -2.41
HHO1P53551 PKH2YOL100W 3246 nt-0.01□□□□□ -2.41
HHO1P53551 FYV10YIL097W 1551 nt-0.01□□□□□ -2.41
HHO1P53551 RSM23YGL129C 1353 nt-0.02□□□□□ -2.41
HHO1P53551 YER188C-AYER188C-A 300 nt-0.02□□□□□ -2.41
HHO1P53551 BIG1YHR101C 1008 nt-0.02□□□□□ -2.41
HHO1P53551 CMC1YKL137W 336 nt-0.02□□□□□ -2.41
HHO1P53551 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-0.02□□□□□ -2.41
HHO1P53551 BSC3YLR465C 309 nt-0.02□□□□□ -2.41
HHO1P53551 RCN2YOR220W 798 nt-0.02□□□□□ -2.41
HHO1P53551 AI1Q0050 2505 nt-0.03□□□□□ -2.41
HHO1P53551 VIK1YPL253C 1944 nt-0.03□□□□□ -2.41
HHO1P53551 BIR1YJR089W 2865 nt-0.04□□□□□ -2.42
HHO1P53551 VMA21YGR105W 234 nt-0.05□□□□□ -2.42
HHO1P53551 YLR217WYLR217W 324 nt-0.05□□□□□ -2.42
HHO1P53551 YOR053WYOR053W 342 nt-0.05□□□□□ -2.42
HHO1P53551 YJR079WYJR079W 330 nt-0.06□□□□□ -2.42
HHO1P53551 SDS22YKL193C 1017 nt-0.06□□□□□ -2.42
HHO1P53551 YLR271WYLR271W 825 nt-0.06□□□□□ -2.42
HHO1P53551 VAM3YOR106W 852 nt-0.06□□□□□ -2.42
HHO1P53551 YOR248WYOR248W 303 nt-0.06□□□□□ -2.42
HHO1P53551 PRP5YBR237W 2550 nt-0.07□□□□□ -2.42
HHO1P53551 YGL015CYGL015C 393 nt-0.07□□□□□ -2.42
HHO1P53551 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.08□□□□□ -2.42
HHO1P53551 YBL062WYBL062W 381 nt-0.08□□□□□ -2.42
HHO1P53551 RPS30BYOR182C 192 nt-0.08□□□□□ -2.42
HHO1P53551 snR13snR13 124 nt-0.08□□□□□ -2.42
HHO1P53551 YPR096CYPR096C 303 nt-0.08□□□□□ -2.42
HHO1P53551 YPL044CYPL044C 549 nt-0.09□□□□□ -2.42
HHO1P53551 snR190snR190 190 nt-0.09□□□□□ -2.42
HHO1P53551 PRP42YDR235W 1635 nt-0.09□□□□□ -2.42
HHO1P53551 CWC23YGL128C 852 nt-0.1□□□□□ -2.43
HHO1P53551 INP2YMR163C 2118 nt-0.1□□□□□ -2.43
HHO1P53551 CUL3YGR003W 2235 nt-0.11□□□□□ -2.43
HHO1P53551 snR5snR5 204 nt-0.11□□□□□ -2.43
HHO1P53551 MCM10YIL150C 1716 nt-0.12□□□□□ -2.43
HHO1P53551 SSS1YDR086C 243 nt-0.12□□□□□ -2.43
HHO1P53551 YDR269CYDR269C 324 nt-0.12□□□□□ -2.43
HHO1P53551 WIP1YDR374W-A 270 nt-0.12□□□□□ -2.43
HHO1P53551 YJL135WYJL135W 318 nt-0.12□□□□□ -2.43
HHO1P53551 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.12□□□□□ -2.43
HHO1P53551 YCL002CYCL002C 792 nt-0.12□□□□□ -2.43
HHO1P53551 ORC3YLL004W 1851 nt-0.12□□□□□ -2.43
HHO1P53551 RCO1YMR075W 2055 nt-0.12□□□□□ -2.43
HHO1P53551 YLR232WYLR232W 348 nt-0.13□□□□□ -2.43
HHO1P53551 MRPL50YNR022C 420 nt-0.13□□□□□ -2.43
HHO1P53551 COG8YML071C 1824 nt-0.13□□□□□ -2.43
HHO1P53551 ASE1YOR058C 2658 nt-0.13□□□□□ -2.43
HHO1P53551 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.14□□□□□ -2.43
HHO1P53551 YNL050CYNL050C 813 nt-0.14□□□□□ -2.43
HHO1P53551 YPL185WYPL185W 396 nt-0.14□□□□□ -2.43
HHO1P53551 STE5YDR103W 2754 nt-0.15□□□□□ -2.43
HHO1P53551 RPL35AYDL191W 363 nt-0.15□□□□□ -2.43
HHO1P53551 YGR228WYGR228W 345 nt-0.15□□□□□ -2.43
HHO1P53551 RPB10YOR210W 213 nt-0.15□□□□□ -2.43
HHO1P53551 LEE1YPL054W 906 nt-0.15□□□□□ -2.43
HHO1P53551 YBR064WYBR064W 429 nt-0.15□□□□□ -2.43
HHO1P53551 HAL9YOL089C 3093 nt-0.15□□□□□ -2.43
HHO1P53551 SPO13YHR014W 876 nt-0.16□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.16□□□□□ -2.44
HHO1P53551 IRC16YPR038W 360 nt-0.16□□□□□ -2.44
HHO1P53551 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt-0.17□□□□□ -2.44
HHO1P53551 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt-0.17□□□□□ -2.44
HHO1P53551 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt-0.17□□□□□ -2.44
HHO1P53551 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt-0.17□□□□□ -2.44
HHO1P53551 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt-0.17□□□□□ -2.44
HHO1P53551 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt-0.17□□□□□ -2.44
HHO1P53551 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt-0.17□□□□□ -2.44
HHO1P53551 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt-0.17□□□□□ -2.44
HHO1P53551 OLI1Q0130 231 nt-0.17□□□□□ -2.44
HHO1P53551 RPS27AYKL156W 249 nt-0.17□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.17□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.17□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.18□□□□□ -2.44
HHO1P53551 COX5BYIL111W 456 nt-0.18□□□□□ -2.44
HHO1P53551 PHS1YJL097W 654 nt-0.18□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YLR198CYLR198C 360 nt-0.18□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.19□□□□□ -2.44
HHO1P53551 ILM1YJR118C 612 nt-0.19□□□□□ -2.44
HHO1P53551 POP7YBR167C 423 nt-0.19□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YDR029WYDR029W 315 nt-0.2□□□□□ -2.44
HHO1P53551 ULI1YFR026C 510 nt-0.2□□□□□ -2.44
HHO1P53551 PRP21YJL203W 843 nt-0.2□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.2□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YMR321CYMR321C 318 nt-0.2□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.2□□□□□ -2.44
HHO1P53551 EFR3YMR212C 2349 nt-0.21□□□□□ -2.44
HHO1P53551 OST4YDL232W 111 nt-0.21□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.21□□□□□ -2.44
HHO1P53551 MRPL32YCR003W 552 nt-0.22□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.22□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YGL239CYGL239C 315 nt-0.22□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YPT6YLR262C 648 nt-0.22□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YOL160WYOL160W 342 nt-0.22□□□□□ -2.44
HHO1P53551 YBR063CYBR063C 1215 nt-0.22□□□□□ -2.44
HHO1P53551 snR45snR45 172 nt-0.22□□□□□ -2.44
HHO1P53551 RPS26AYGL189C 360 nt-0.23□□□□□ -2.45
HHO1P53551 YGR115CYGR115C 780 nt-0.23□□□□□ -2.45
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