Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB2P47870 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB2P47870 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB2P47870 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB2P47870 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB2P47870 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB2P47870 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABRB2P47870 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABRB2P47870 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABRB2P47870 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GABRB2P47870 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABRB2P47870 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABRB2P47870 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABRB2P47870 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABRB2P47870 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRB2P47870 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms