RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: P40317
SOK1, Protein SOK1, yeast
Predictions only
Length
901 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SOK1
P40317
tT(AGU)I1
tT(AGU)I1
73 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
tT(AGU)I2
tT(AGU)I2
73 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
tT(AGU)J
tT(AGU)J
73 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
tT(AGU)N1
tT(AGU)N1
73 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
tT(AGU)N2
tT(AGU)N2
73 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
tT(AGU)O1
tT(AGU)O1
73 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
tT(AGU)O2
tT(AGU)O2
73 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
YPR159C-A
YPR159C-A
102 nt
0.63
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
URM1
YIL008W
300 nt
0.62
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
PHS1
YJL097W
654 nt
0.62
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
NFU1
YKL040C
771 nt
0.62
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
YBR221W-A
YBR221W-A
105 nt
0.62
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
SET3
YKR029C
2256 nt
0.61
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
YCR001W
YCR001W
315 nt
0.61
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
MXR1
YER042W
555 nt
0.61
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
EAF6
YJR082C
342 nt
0.61
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
YPR153W
YPR153W
423 nt
0.61
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
NOC3
YLR002C
1992 nt
0.61
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
YLL032C
YLL032C
2478 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
YDR114C
YDR114C
303 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
CYC7
YEL039C
342 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
YGL239C
YGL239C
315 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
BIG1
YHR101C
1008 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
YLR146W-A
YLR146W-A
189 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
YMR141W-A
YMR141W-A
225 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
PBI2
YNL015W
228 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
CDC33
YOL139C
642 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
MYO1
YHR023W
5787 nt
0.6
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
YDL158C
YDL158C
309 nt
0.59
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
MRPL31
YKL138C
396 nt
0.59
□□□□□ -2.31
SOK1
P40317
MPT5
YGL178W
2580 nt
0.59
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
SCW11
YGL028C
1629 nt
0.59
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
RFX1
YLR176C
2436 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
WIP1
YDR374W-A
270 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YER076W-A
YER076W-A
348 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YGR045C
YGR045C
363 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YIL066W-A
YIL066W-A
444 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
AIM29
YKR074W
468 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YOR192C-C
YOR192C-C
237 nt
0.58
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
STO1
YMR125W
2586 nt
0.57
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
UPS1
YLR193C
528 nt
0.57
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YOR032W-A
YOR032W-A
201 nt
0.57
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YBR012C
YBR012C
420 nt
0.57
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
SWI6
YLR182W
2412 nt
0.56
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
SWF1
YDR126W
1011 nt
0.56
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YEL030C-A
YEL030C-A
315 nt
0.56
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YER087C-A
YER087C-A
552 nt
0.56
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
PAU12
YGR294W
363 nt
0.56
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YML108W
YML108W
318 nt
0.56
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
FIG4
YNL325C
2640 nt
0.55
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YDR269C
YDR269C
324 nt
0.55
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
QCR9
YGR183C
201 nt
0.55
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YGR290W
YGR290W
444 nt
0.55
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
FYV7
YLR068W
456 nt
0.55
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YCK3
YER123W
1575 nt
0.54
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
SLY1
YDR189W
2001 nt
0.54
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YDL196W
YDL196W
330 nt
0.54
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YGR042W
YGR042W
816 nt
0.54
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YIL059C
YIL059C
366 nt
0.54
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YKL145W-A
YKL145W-A
93 nt
0.54
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
RRT1
YBL048W
312 nt
0.54
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
LCD1
YDR499W
2244 nt
0.54
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
ALY2
YJL084C
3141 nt
0.54
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
LTE1
YAL024C
4308 nt
0.53
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YHR125W
YHR125W
306 nt
0.53
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YOR199W
YOR199W
330 nt
0.53
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YBR076C-A
YBR076C-A
267 nt
0.53
□□□□□ -2.32
SOK1
P40317
YML002W
YML002W
2214 nt
0.52
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
NPC2
YDL046W
522 nt
0.52
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
YBL071C
YBL071C
309 nt
0.52
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
YNL122C
YNL122C
348 nt
0.52
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
ZEO1
YOL109W
342 nt
0.52
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
YPL182C
YPL182C
384 nt
0.52
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
YBR200W-A
YBR200W-A
165 nt
0.52
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
FMP27
YLR454W
7887 nt
0.52
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
YDL206W
YDL206W
2289 nt
0.51
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
YEL050W-A
YEL050W-A
192 nt
0.51
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
BI2
Q0110
1272 nt
0.51
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
TIM13
YGR181W
318 nt
0.51
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
RPL38
YLR325C
237 nt
0.51
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
RIM20
YOR275C
1986 nt
0.51
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
PDE2
YOR360C
1581 nt
0.51
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
UTP10
YJL109C
5310 nt
0.5
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
snR72
snR72
98 nt
0.5
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
UBC7
YMR022W
498 nt
0.5
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
TOM22
YNL131W
459 nt
0.5
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
YOL014W
YOL014W
375 nt
0.5
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
EFR3
YMR212C
2349 nt
0.5
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
ZIP2
YGL249W
2115 nt
0.5
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
SLI15
YBR156C
2097 nt
0.5
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
AIM44
YPL158C
2277 nt
0.49
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
YDL011C
YDL011C
324 nt
0.49
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
YHR130C
YHR130C
336 nt
0.49
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
YJL020W-A
YJL020W-A
258 nt
0.49
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
YAL016C-B
YAL016C-B
186 nt
0.49
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
YJL135W
YJL135W
318 nt
0.49
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
YLR287C
YLR287C
1068 nt
0.49
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
GEA2
YEL022W
4380 nt
0.49
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
MMS4
YBR098W
2076 nt
0.49
□□□□□ -2.33
SOK1
P40317
RPS27A
YKL156W
249 nt
0.48
□□□□□ -2.33
First
Previous
66
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.5 ms