Protein–RNA interactions for Protein: P40317

SOK1, Protein SOK1, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK1P40317 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.63□□□□□ -2.31
SOK1P40317 URM1YIL008W 300 nt0.62□□□□□ -2.31
SOK1P40317 PHS1YJL097W 654 nt0.62□□□□□ -2.31
SOK1P40317 NFU1YKL040C 771 nt0.62□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.62□□□□□ -2.31
SOK1P40317 SET3YKR029C 2256 nt0.61□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YCR001WYCR001W 315 nt0.61□□□□□ -2.31
SOK1P40317 MXR1YER042W 555 nt0.61□□□□□ -2.31
SOK1P40317 EAF6YJR082C 342 nt0.61□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YPR153WYPR153W 423 nt0.61□□□□□ -2.31
SOK1P40317 NOC3YLR002C 1992 nt0.61□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YLL032CYLL032C 2478 nt0.6□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YDR114CYDR114C 303 nt0.6□□□□□ -2.31
SOK1P40317 CYC7YEL039C 342 nt0.6□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YGL239CYGL239C 315 nt0.6□□□□□ -2.31
SOK1P40317 BIG1YHR101C 1008 nt0.6□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.6□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.6□□□□□ -2.31
SOK1P40317 PBI2YNL015W 228 nt0.6□□□□□ -2.31
SOK1P40317 CDC33YOL139C 642 nt0.6□□□□□ -2.31
SOK1P40317 MYO1YHR023W 5787 nt0.6□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YDL158CYDL158C 309 nt0.59□□□□□ -2.31
SOK1P40317 MRPL31YKL138C 396 nt0.59□□□□□ -2.31
SOK1P40317 MPT5YGL178W 2580 nt0.59□□□□□ -2.32
SOK1P40317 SCW11YGL028C 1629 nt0.59□□□□□ -2.32
SOK1P40317 RFX1YLR176C 2436 nt0.58□□□□□ -2.32
SOK1P40317 WIP1YDR374W-A 270 nt0.58□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.58□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YGR045CYGR045C 363 nt0.58□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.58□□□□□ -2.32
SOK1P40317 AIM29YKR074W 468 nt0.58□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.58□□□□□ -2.32
SOK1P40317 STO1YMR125W 2586 nt0.57□□□□□ -2.32
SOK1P40317 UPS1YLR193C 528 nt0.57□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.57□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YBR012CYBR012C 420 nt0.57□□□□□ -2.32
SOK1P40317 SWI6YLR182W 2412 nt0.56□□□□□ -2.32
SOK1P40317 SWF1YDR126W 1011 nt0.56□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.56□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.56□□□□□ -2.32
SOK1P40317 PAU12YGR294W 363 nt0.56□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YML108WYML108W 318 nt0.56□□□□□ -2.32
SOK1P40317 FIG4YNL325C 2640 nt0.55□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YDR269CYDR269C 324 nt0.55□□□□□ -2.32
SOK1P40317 QCR9YGR183C 201 nt0.55□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YGR290WYGR290W 444 nt0.55□□□□□ -2.32
SOK1P40317 FYV7YLR068W 456 nt0.55□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YCK3YER123W 1575 nt0.54□□□□□ -2.32
SOK1P40317 SLY1YDR189W 2001 nt0.54□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YDL196WYDL196W 330 nt0.54□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YGR042WYGR042W 816 nt0.54□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YIL059CYIL059C 366 nt0.54□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.54□□□□□ -2.32
SOK1P40317 RRT1YBL048W 312 nt0.54□□□□□ -2.32
SOK1P40317 LCD1YDR499W 2244 nt0.54□□□□□ -2.32
SOK1P40317 ALY2YJL084C 3141 nt0.54□□□□□ -2.32
SOK1P40317 LTE1YAL024C 4308 nt0.53□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YHR125WYHR125W 306 nt0.53□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YOR199WYOR199W 330 nt0.53□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.53□□□□□ -2.32
SOK1P40317 YML002WYML002W 2214 nt0.52□□□□□ -2.33
SOK1P40317 NPC2YDL046W 522 nt0.52□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YBL071CYBL071C 309 nt0.52□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YNL122CYNL122C 348 nt0.52□□□□□ -2.33
SOK1P40317 ZEO1YOL109W 342 nt0.52□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YPL182CYPL182C 384 nt0.52□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.52□□□□□ -2.33
SOK1P40317 FMP27YLR454W 7887 nt0.52□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YDL206WYDL206W 2289 nt0.51□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.51□□□□□ -2.33
SOK1P40317 BI2Q0110 1272 nt0.51□□□□□ -2.33
SOK1P40317 TIM13YGR181W 318 nt0.51□□□□□ -2.33
SOK1P40317 RPL38YLR325C 237 nt0.51□□□□□ -2.33
SOK1P40317 RIM20YOR275C 1986 nt0.51□□□□□ -2.33
SOK1P40317 PDE2YOR360C 1581 nt0.51□□□□□ -2.33
SOK1P40317 UTP10YJL109C 5310 nt0.5□□□□□ -2.33
SOK1P40317 snR72snR72 98 nt0.5□□□□□ -2.33
SOK1P40317 UBC7YMR022W 498 nt0.5□□□□□ -2.33
SOK1P40317 TOM22YNL131W 459 nt0.5□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YOL014WYOL014W 375 nt0.5□□□□□ -2.33
SOK1P40317 EFR3YMR212C 2349 nt0.5□□□□□ -2.33
SOK1P40317 ZIP2YGL249W 2115 nt0.5□□□□□ -2.33
SOK1P40317 SLI15YBR156C 2097 nt0.5□□□□□ -2.33
SOK1P40317 AIM44YPL158C 2277 nt0.49□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YDL011CYDL011C 324 nt0.49□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YHR130CYHR130C 336 nt0.49□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.49□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.49□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YJL135WYJL135W 318 nt0.49□□□□□ -2.33
SOK1P40317 YLR287CYLR287C 1068 nt0.49□□□□□ -2.33
SOK1P40317 GEA2YEL022W 4380 nt0.49□□□□□ -2.33
SOK1P40317 MMS4YBR098W 2076 nt0.49□□□□□ -2.33
SOK1P40317 RPS27AYKL156W 249 nt0.48□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.9 ms