Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD13P35453 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms