Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab21P35282 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab21P35282 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab21P35282 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms