Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms