Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl13aP19253 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms