Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
KIAA0556O60303 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms