Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL13O43927 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms